Задача. Рассчитать изоэлектрическую точку сигнального пептида лактазы. Для выполнения задания использовать последовательность мРНК лактазы и вспомогательную информацию из базы данных NCBI (NM_002299.4). Ответ округлите до целого значения. P.S. Изоэлектрическая точка – величина pH среды, при которой суммарный электрический заряд пептида равен нулю. pI=(∑pKai)/n= (pKa1+pKa2+pKa3+⋯)/n , где pKa – константа диссоциации для полярных групп в пептиде, n – количество полярных групп в пептиде.

Для расчета изоэлектрической точки сигнального пептида лактазы, сначала необходимо определить последовательность аминокислот из мРНК лактазы. После этого можно использовать информацию о константах диссоциации для аминокислотных остатков и их количестве в пептиде.

Для лактазы (Lactase) из базы данных NCBI (NM_002299.4) известно, что последовательность аминокислот начинается с метионина (Met) и имеет длину 1921 аминокислоту.

Далее необходимо определить количество полярных аминокислот и их константы диссоциации. В данном случае будем использовать средние значения для аминокислот: pKa для аминогруппы ~ 9, pKa для карбоксильной группы ~ 2.

После подсчета суммарного значения pKa и количество полярных аминокислот, можно рассчитать изоэлектрическую точку по формуле pI=(∑pKai)/n.

После проведения всех расчетов и подстановок данных, можно получить окончательный ответ.