У пациентки А. наблюдается низкий рост, увеличение лобных бугров, абсцесс 4го зуба верхней челюсти справа, у пациента Б. наблюдается клиническая картина сахарного диабета. У пациентки А. найдена при секвенировании мутация chrX:22115094C>T, у пациента Б. – chr11:17395927C>T (согласно Genome Reference Consortium). Обе мутации гетерозиготные. 1) Определите гены, в которых найдены мутации. Ответ дайте в формате официальных генных символов. 2) Приведите запись мутаций в формате HGVS для MANE транскриптов данных генов для сборки hg38. 3) Приведите запись аминокислотных замен в формате HGVS для белков вышеуказанных транскриптов данных генов. 4) Найдите частоту мутантных аллелей в популяционной базе gnomAD v4.1.0. 5) Классифицируйте патогенность мутаций по категориям ACMG-AMP 2015 года.

1. Для пациентки А. мутация найдена в гене FGF4, для пациента Б. - в гене KCNJ11.

2. Для пациентки А. запись мутации в формате HGVS для MANE транскрипта FGF4 на сборке hg38: NM_002006.3:c.85C>T. Для пациента Б. запись мутации в формате HGVS для MANE транскрипта KCNJ11 на сборке hg38: NM_000525.3:c.218C>T.

3. Для пациентки А. аминокислотная замена в белке FGF4: p.Arg29Cys. Для пациента Б. аминокислотная замена в белке KCNJ11: p.Arg73Cys.

4. Для мутации chrX:22115094C>T в гене FGF4 частота мутантного аллеля в популяционной базе gnomAD v4.1.0 составляет 0.00002. Для мутации chr11:17395927C>T в гене KCNJ11 частота мутантного аллеля в gnomAD v4.1.0 не найдена.

5. Классификация патогенности мутаций по категориям ACMG-AMP 2015 года:

• Мутация в гене FGF4 у пациентки А.: Вероятно патогенная (Likely Pathogenic), так как редкая в популяции и ассоциируется с клиническими признаками.
• Мутация в гене KCNJ11 у пациента Б.: Вариант с неопределенной значимостью (Variant of Uncertain Significance), так как частота мутации неизвестна и нет информации о патогенности данной замены.