Секвенирование методом дробовика (shotgun sequencing) идеально подходит для расшифровки крупных геномов. Преимуществом является его простота и возможность автоматизации. Исходную ДНК разбивают на множество мелких фрагментов случайного размера. Каждый из этих фрагментов отдельно секвенируют. Перекрывающиеся полученные чтения (риды) объединяют с помощью компьютерных алгоритмов. Затем анализируют полученную последовательность. Исследователи планируют секвенировать геном дрожжей, размер которого составляет 12 миллионов баз (12 Мб). Они решили разбить геном на фрагменты длиной 1000 баз. Каждое чтение (рид) имеет точность 99.9%.Восстановите последовательность участка смысловой цепи ДНК по имеющимся фрагментам ридов.

Для восстановления последовательности участка смысловой цепи ДНК по имеющимся фрагментам ридов необходимо объединить перекрывающиеся риды с помощью компьютерных алгоритмов. После объединения ридов и анализа полученной последовательности можно восстановить исходную последовательность участка смысловой цепи ДНК.

Для генома дрожжей размером 12 Мб, разбитого на фрагменты длиной 1000 баз, будет получено 12 000 фрагментов. Каждый из этих фрагментов будет секвенирован с точностью 99.9%. После объединения и анализа ридов исследователи смогут восстановить последовательность участка смысловой цепи ДНК и провести дальнейший анализ генома дрожжей.