Особенностью ферментов является то, что они обладают высокой специфичностью, то есть могут ускорять только одну реакцию или реакции одного типа. Для ферментов самым важным является способность различать среди множества молекул именно те, которые должны вступить в реакцию (эти молекулы называют субстратом). Субстрат и фермент подходят друг к другу как ключ к замку: Биокаталитический процесс состоит из двух этапов: сначала фермент (E) отыскивает среди множества разнообразных молекул именно ту, которая должна вступить в реакцию, и соединяется с ней в одно целое – фермент-субстратный комплекс (ES). Фермент как бы захватывает молекулу субстрата (S), каким-то образом «обрабатывает» её, а затем отделяет уже изменённую молекулу, которая называется продуктом реакции (P).

Этот процесс происходит благодаря активному центру фермента, который обладает определенной пространственной структурой и химическими свойствами, способными взаимодействовать с определенными молекулами субстрата.

Ферменты могут быть использованы для ускорения различных биохимических реакций в организме, таких как синтез молекул, расщепление пищи, обмен веществ и многие другие процессы. Их специфичность и эффективность делают их важными участниками метаболизма и жизнедеятельности клеток.