Известно, что комплементарные цепи нуклеиновых кислот антипараллельны (5’ концу одной цепи соответствует 3’ конец другой цепи). Синтез нуклеиновых кислот начинается с 5’ конца. Рибосома движется по иРНК в направлении от 5’ к 3’ концу. Ген имеет кодирующую и некодирующую области. Кодирующая область гена называется открытой рамкой считывания. Фрагмент конца гена имеет следующую последовательность нуклеотидов (нижняя цепь матричная (транскрибируемая): 5’-ЦТЦГАТТГАГГЦАТТАТАГАГЦАТЦГ-3’ 3’-ГАГЦТААЦТЦЦГТААТАТЦТЦГТАГЦ-5’. Определите верную открытую рамку считывания и найдите последовательность аминокислот во фрагменте конца полипептидной цепи.

Откртая рамка считывания начинается с старт-кодона AUG (метионин) и заканчивается стоп-кодоном UAA, UAG или UGA.

Последовательность нуклеотидов в матричной цепи: 5’-ЦТЦГАТТГАГГЦАТТАТАГАГЦАТЦГ-3’

С учетом комплементарности цепей, последовательность нуклеотидов в исходной цепи будет: 3’-ГАГЦТААЦТЦЦГТААТАТЦТЦГТАГЦ-5’

Старт-кодон AUG находится в следующей позиции: 5’-ЦТЦГАТТГАГГЦАТТАТАГАГЦАТЦГ-3’ AUG

Откртая рамка считывания: AUG ГГЦ АУА ГАГ ЦАТ ТЦГ

Переводим последовательность нуклеотидов в последовательность аминокислот: AUG - метионин ГГЦ - глицин АУА - изолейцин ГАГ - глутаминовая кислота ЦАТ - гистидин ТЦГ - серин

Таким образом, последовательность аминокислот во фрагменте конца полипептидной цепи: метионин-глицин-изолейцин-глутаминовая кислота-гистидин-серин.