Для реакции ПЦР использовали мастер-микс 5х, содержащий Taq ДНК-полимеразу с «горячим стартом», смесь dNTP (dATP, dGTP и dCTP — 0.6 мM, dTTP/dUTP — 0.3 мM), 15 мМ ионы Mg2+, реакционный буфер, глицерин, красители. В реакционную смесь объемом 25 мкл, содержащую 1х мастер-микс, добавили прямые (ATG) и обратные (GCA) праймеры по 0,4 мкМ и ДНК-матрицу: ATGACGAGGTCCTGC – 5 копий на мкл реакционной смеси. После 10 раундов репликации полученную смесь обработали UDG – урацил-ДНК-гликозилазой, которая гидролизует урацил в составе ДНК. Задача. Определить процент продуктов, подвергшихся гидролизу UDG, если ДНК-полимераза включает dUTP каждый третий комплементарный нуклеотид от начала синтеза новой цепи. В ответе привести целое число

Процент продуктов, подвергшихся гидролизу UDG, можно определить по формуле:

$\% = 100 \times (1 - (1 - p)^n)$

Где p - вероятность вставки dUTP (0.3), n - количество вставок dUTP.

Поскольку dUTP вставляется каждый третий комплементарный нуклеотид, то количество вставок dUTP будет равно количеству комплементарных нуклеотидов деленному на 3:

$n = \frac{15}{3} = 5$

Теперь можем подставить значения в формулу:

$\% = 100 \times (1 - (1 - 0.3)^5) = 100 \times (1 - 0.7^5) = 100 \times (1 - 0.16807) = 83$

Ответ: 83%